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之前小编给大家介绍了2013年诺贝尔生理学或医学奖得主Thomas C. Südhof教授重磅加盟CNAF2019的消息,本届中国核酸国际论坛将由2位诺贝尔奖得主领衔,前不久还有一位国际学术大咖加盟2019CNAF!这位就是美国科学院院士、美国人文与科学院院士Dinshaw J. Patel教授。今天,小编就带大家先来了解一下这位RNAi和表观遗传学领域的重量级科学家吧~各位老师同学如需报名参会并同嘉宾大咖面对面交流,欢迎您联系论坛会务组。

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嘉宾简介

美国科学院院士Dinshaw J. Patel教授重磅加盟2019中国核酸国际论坛-肽度TIMEDOO
Dinshaw J. Patel教授现为美国科学院院士,美国人文与科学院院士,美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心教授,是RNA干扰和表观遗传学领域的知名结构生物学专家。Dinshaw J. Patel教授1968年获得美国纽约大学化学博士学位,1992年成为美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心教授,并着手建立结构生物学平台。从2000年开始转型用X射线衍射晶体学技术,结合其他生物化学和生物物理学手段来探寻生物体内有重要调控功能,并与疾病密切相关的生物大分子的结构和功能。2004年获得美国哥伦比亚大学终身教授职位,在之后的8年里一直从事用核磁共振技术探索核酸与靶向核酸药物的结构生物学研究。2015年11月,Dinshaw J. Patel教授受邀成为南方科技大学生物系的讲座教授。Dinshaw J. Patel教授发表过500余篇论文和综述,从其2003年至今的论文摘录里,每年都有大量的文章发表在Nature、 Science、 Cell等国际权威学术期刊上。

    主要研究项目    

一、RNA沉默
Dinshaw J. Patel教授实验室的长期研究目标包括:(1)通过Dicer的核酸内切酶活性将长双链RNA加工成siRNAs;(2)在RNA诱导的沉默复合物(RISC)中,Argonaute(表现出切割活性的关键组分)可诱导向导链介导的靶RNA裂解。Dinshaw J. Patel教授还对(3)沿着microRNA (miRNA)生物发生通路的蛋白-RNA复合物感兴趣,这些复合物介导初级miRNAs加工为其前体对应物,以及与miRNA向导链介导的靶RNAs裂解、翻译抑制或降解相关的过程。
Dicer介导的dsRNA裂解
1. A phosphate-binding pocket within the platform-PAZ-connector helix cassette of human Dicer.美国科学院院士Dinshaw J. Patel教授重磅加盟2019中国核酸国际论坛-肽度TIMEDOO
Tian Y, et al. Molecular cell, 2014, 53(4): 606-616.
2. Dicer Recognizes the 5’-end of RNA for Efficient and Accurate Processing.美国科学院院士Dinshaw J. Patel教授重磅加盟2019中国核酸国际论坛-肽度TIMEDOO
Park J E, et al. Nature, 2011, 475(7355): 201.
3. Inside-Out Mechanism of Dicers from Budding Yeasts.美国科学院院士Dinshaw J. Patel教授重磅加盟2019中国核酸国际论坛-肽度TIMEDOO
Weinberg D E, et al. Cell, 2011, 146(2): 262-276.
Argonaute介导的靶RNA裂解
1. Eukaryote-Specific Insertion Elements Control Human ARGONAUTE Slicer Activity.美国科学院院士Dinshaw J. Patel教授重磅加盟2019中国核酸国际论坛-肽度TIMEDOO
Nakanishi K, et al. Cell reports, 2013, 3(6): 1893-1900.
2. Nucleation, Propagation and Cleavage of Target RNAs in Eubacterial Ago Silencing Complexes美国科学院院士Dinshaw J. Patel教授重磅加盟2019中国核酸国际论坛-肽度TIMEDOO
Wang Y, et al. Nature, 2009, 461(7265): 754.
3. Ternary Eubacterial Argonaute Silencing Complex Containing Guide-Target Duplex Spanning the Seed Segment美国科学院院士Dinshaw J. Patel教授重磅加盟2019中国核酸国际论坛-肽度TIMEDOO
Wang Y, et al. Nature, 2008, 456(7224): 921.
piRNA生物发生
piRNAs是后生动物生殖细胞中各种转座因子转录和转录后抑制的指导因子。目前的工作是了解蛋白质和相关RNAs在piRNA生物发生机制中的作用。
  1. Cutoff Suppresses RNA Polymerase II termination to ensure expression of piRNA precursors.
  2. Recruitment of Aub and Ago3 to Nuage to form a Krimper assembled ping-pong complex.
  3. Transgenerationally inherited piRNAs trigger piRNA biogeneis.
二、CRISPR-Cas Endonucleses
基于利用CRISPR-Cas系统可编程的dsDNA裂解技术,可以实现高效和位点特异性基因组工程。单组分Cas和多组分级联复合物的结构研究为dsDNA和RNA靶标的裂解化学机理提供了新的思路。未来的挑战包括了解不同的CRISPR-Cas系统在努力扩展和增强其作为基因组编辑工具的适用性时所采用的各种机制。目前还在努力对涉及进化噬菌体抑制蛋白的识别原理提供结构性的解释,这些蛋白抑制CRISPR-Cas通路,从而调节CRISPR-Cas系统的基因组工程活性。
1. Cpf1 and C2c1 Endoribonucleses.
2. PAM-dependent Target DNA Recognition and Cleavage by C2c1 CRISPR-Cas Endonuclease.

美国科学院院士Dinshaw J. Patel教授重磅加盟2019中国核酸国际论坛-肽度TIMEDOO

Yang H, et al. Cell, 2016, 167(7): 1814-1828. e12.
3. Type V CRISPR-Cas Cpf1 endonuclease employs a unique mechanism for crRNA-mediated target DNA recognition.美国科学院院士Dinshaw J. Patel教授重磅加盟2019中国核酸国际论坛-肽度TIMEDOO
Gao P, et al. Cell research, 2016, 26(8): 901.
除此以外,Dinshaw J. Patel教授实验室的研究项目还包括:三、组蛋白标记介导的表观遗传调控四、DNA甲基化及其与组蛋白甲基化的交互作用

五、组蛋白分子伴侣

六、胞质后生动物核酸传感器

七、核糖开关与核酶

八、蛋白质-RNA复合物介导疾病综合症

九、脂质转运蛋白

荣誉与奖项

1961  Jamshetjee N. Tata Fellow1983  AT&T Bell Laboratories Distinguished Technical Staff Award1992  Abby Rockefeller Mauzé Chair in Experimental Therapeutics (MSKCC)

1997  Distinguished Alumnus Award, New York University

1997  Harvey Society (Vice-President 97-98; President 98-99)

2009  Member, National Academy of Sciences, USA

2013  NIH Directors Transformative R01 Award (with Thomas Tuschl and Uwe Ohler)

2014  2014 FEZANA Jamshed and Shirin Guzdar Excellence in Profession Award

2014  Member, American Academy of Arts and Sciences, USA

学术交流活动

2010  John D. Roberts Lecture, California Institute of Technology, Pasadena, CA2011  Keystone Symposium on RNA Silencing, Monterey, CA2011  C. C. Tan Lecture, Fudan University, Shanghai, China

2012  IAS Distinguished Lecture, Hong Kong Univ. of Science & Tech., Hong Kong, China

2013  Epigenetics Symposium, University of Michigan, Ann Arbor, MI

2013  NCI Eminent Lecture, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, USA

2014  Kiran Mazumdar Shaw Lecture, Inst. Bioinform. & Applied Biotech., Bangalore, India

2014  Dean’s Lecture, Virginia Commonwealth University, Richmond, VA

2014  Master Forum Lecture, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing, China

2014  Cell Press Lab Links Epigenetics Symposium, Beijing, China

2014  IUBMB International Conference, Academica Sinica, Taipei, Taiwan

2014  Shanghai Structural Biology Network Meeting, Shanghai, China

2015  Einstein Professorship of Chinese Academy of Sciences, China

2015  Shizhang Bei Lectureship, CAS Institute Biophysics, Beijing, China

2015  Science Across China Lectureship, Yunnan University, Kunming, China

2015  Joint Life Sciences Center, Tsinghua – Peking Universities, Beijing, China

2016  Distinguished Lecture, KAUST, Saudi Arabia

2016  RNA: Structure Meets Function Meeting, Stockholm, Sweden

2016  Shenzhen International Biotechnology Summit, Shenzhen, China

主要代表文章

[1] Stromme, C. B., Hammond, C., Huang, H., Patel, D. J. & Groth, A. (2017). Histone chaperone networks shaping chromatin function. Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 18, 141-158.[2] Guo, T. W., Bartesaghi, A., Yang, H., Falconieri, V., Rao, P., Merk, A., Eng, E. T., Raczkowski, A. M., Fox, T., Earl, L. A., Patel, D. J. & Subramaniam, S. (2017). Cryo-EM structures reveal mechanism and inhibition of DNA targeting by a CRISPR-Cas surveillance complex. Cell, 171, 414-426.[3] Yang, H., Gao, P., Rajashankar, K. R., & Patel, D. J. (2017). PAM-dependent target DNA recognition and cleavage by C2c1 CRISPR-Cas endonuclease. Cell, 167,1814-1828.

[4] Saredi, G., Huang, H., Hammond, C., Bekker-Jensen, S., Forne, I., Reveron-Gomez, N., Foster, B. M., Mlejnkova, L., Bartke, T., Cejka, P., Mailand, N., Imhof, A., Patel, D. J. and Groth, A. (2016). H4 K20me0 marks post-replicative chromatin and recruits the TONSL-MMS22L DNA repair complex. Nature, 534, 714-718.

[5] Sun, X-J., Wang, Z., Wang, L., Jiang, Y., Chen, W-Y., Melnick, A., Patel, D. J., Nimer, S. D. & Roeder, R. G. (2013). A stable transcription factor complex nucleated by oligomeric AML1-ETO controls leukaemogenesis. Nature, 500, 93-97.

[6] Simanshu, D. K., Kamlekar, R. K., Wijesinghe, D. S., Zou, X., Zhai, X., Mishra, S. K., Molotkovsky, J. G., Malinina, L., Hincliffe, E. H., Chalfant, C. E., Brown, R. E. & Patel, D. J. (2013). Non-vesicular trafficking by a ceramide-1-phosphate transfer protein regulates eicosanoids. Nature, 500, 463-467.

[7] Gao, P., Ascano, M., Wu, Y., Barchet, W., Gaffney, B. L., Zillinger, T., Serganov, A., Jones, R. A., Hartmann, G., Tuschl, T. and Patel, D. J. (2013). Cyclic [G(2’,5’)pA(3’,5’)p] is the metazoan second messenger produced by DNA-activated cyclic GMP-AMP synthase. Cell, 153, 1094-1107.

[8] Johnson, L. M., Du, J., Hale, C. J., Bischof, S., Feng, S., Chodavarapu, R. K., Zhong, X., Marson, G., Pellergrini, M., Segal, D. J., Patel, D. J. and Jacobsen, S. E. (2014). SRA/SET domain proteins link RNA polymerase V occupancy to DNA methylation. Nature, 507, 124-128.

[9] Zhong, X., Du, J., Hale, C. J., Gallego-Bartolome, J., Feng, S., Vashisht, A. A., Chory, J., Wohlschlegel, J. A., Patel, D. J. and Jacobsen, S. E. (2014). Molecular mechanism of action of plant DRM de novo DNA methyltransferases. Cell. 157, 1050-1060.

[10] Du, J., Johnson, L. M., Jacobsen, S. E. and Patel, D. J. (2015). DNA methylation pathways and their crosstalk with histone methylation. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 16, 519-532.