2022年11月7-11日·北京·实用生物信息学研讨班
如您所知,近年来,以基因组科学为代表的研究工作和技术平台先后获得各项资助,如国家863计划、973计划、中国科学院知识创新工程、国家重大攻关项目、自然科学基金等。为了辅助广大科研工作者掌握高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能,我中心特举办此“实用生物信息学研讨班”。
主办单位:北京市计算中心有限公司
协办单位:
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
工业和信息化人才培养工程培训基地
北京市大数据教学实践基地
支持单位:肽度TIMEDOO
举 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
课程安排:2022年11月7-11日(周一—周五) 上午9:30-12:00 下午13:30-17:00
日期 | 主题 | 内容 | 备注 |
第一天 | 组学及生物信息学概述 | 1、组学研究概述(基因组学、转录组学、表观组学、蛋白质组学、代谢组学及相关技术介绍)
2、实验设计及测序原理 3、生物信息学背景知识介绍 |
理论 |
Linux服务器使用入门 | 1、掌握Linux系统下的常用命令(重点讲解)
2、掌握Linux环境下软件的安装使用 3、了解Shell脚本的编写 |
实战 | |
R语言入门 | 1、R语言简介
2、R语言安装及配置 3、R语言数据结构 4、R语言数据处理 5、R语言绘图 |
理论+
实战 |
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第二天 | 转录组数据分析 | 1、转录组技术发展前沿动态
2、转录组应用案例及应用热点 3、常用的转录组实验设计及测序建库技术 4、转录组分析方法介绍 |
理论 |
转录组数据分析实例(上机操作) | 1、转录组数据准备和软件介绍及安装
2、转录组数据的比对(重点讲解) 3、表达量估计和分析(重点讲解) |
理论+
实战 |
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第三天 | 基因组重测序与数据分析 | 1、讲解基因组重测序的概念、目的与应用
2、结合实例讲解其原理、数据类型与格式、操作流程、软件等相关知识 |
理论 |
基因组重测序数据分析实例(上机操作) | 1、对二代测序数据的解读
2、数据质量控制及数据过滤 3、使用BWA和Samtools进行数据比对并对比对结果进行可视化(重点讲解) 4、寻找SNP和Indel并进行注释(重点讲解) 5、寻找结构变异并对变异进行注释(重点讲解) |
理论+
实战 |
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第四天 | microRNA测序与数据分析 | 1、microRNA的定义、应用和发展
2、microRNA的生物学过程 3、microRNA研究的实验设计及测序原理 4、microRNA测序数据分析软件(重点讲解) 5、microRNA目前的挑战以及将来的研究前景 6、microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解) 7、近期文献 |
理论 |
microRNA数据分析实例(上机操作) | 1、microRNA测序数据预处理(重点讲解)
2、测序数据长度分布计算 3、microRNA的预测(重点讲解) 4、microRNA碱基偏好性计算 5、microRNA靶标基因预测,结果提取、统计(重点讲解) |
理论+
实战 |
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第五天 | 10×单细胞转录组测序数据分析原理 | 1、单细胞测序技术研究现状及应用
2、单细胞转录组实验设计及建库测序原理(重点介绍10× Genomics) 3、空间转录组实验设计及建库测序原理 |
理论 |
10×单细胞转录组测序数据分析流程上机操作 | 1、10×单细胞软件Cellranger处理测序原始数据实战
2、R包Seurat细胞分群、umap、t-sne、marker基因筛选实战 |
实战 | |
蛋白结构与互作分析 | 1、PyMol
2、Cytoscape |
实战 |
注:内容以实际发生为准;若调,会提前通知。
【报名费用】
注册费:5400元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。
提供当期视频回放以供复习使用(羽林学院平台)。
开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元;
2、4+1团报,可免费赠送一个名额;
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
【付费方式】
手机银行或电子银行转账、银行汇款等
单位全称:北京市计算中心有限公司
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京自贸试验区永丰基地支行
(汇款信息备注:“智能计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)
注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。
【咨询请联系】
QQ号:659230635
微信号:vicolee2021
【注】开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。
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