2024年5月26-6月1日·浙江大学第63期“基因组科学”研习班招生通知
开班时间：2024年5月26-6月1日（26日全天报道，27日起授课）
上课内容：基因组学、系统生物学、蛋白质组学、单细胞组学
上机实习： 基因组数据注释和功能分析；R语言数据分析与绘图；蛋白质结构与功能分析；蛋白质组学数据分析；系统生物学软件实习—–网络结构显示与分析；单细胞转录组数据分析实例；转录组与空间转录组整合分析
著名基因组学专家于军研究员、中科院微生物所胡松年研究员、浙江大学陈铭教授、徐建红教授、钟伯雄教授、杨军教授、谷红仓研究员等多位基因组领域大咖专家为你在高通量分析研究方法和思路方面答疑解惑。
百人平台携手科研：
至今我们已举办62期，每期近百人，学员遍布全国30余个省市。每次研习班都有近30%教授、研究员等高级职称技术人员参加。他们中有一些带着课题或问题前来交流和联系；也有的通过研习班建立了协作关系，共同申请课题，发表论文，其中不少优秀研究成果，已在SCI期刊上发表。
一、培训班上课内容
上课内容涵盖“基因组学—蛋白质组学—系统生物学—单细胞组学”的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。
二、培训班上机内容
本研习班上机实习课采用 “跟我学”方式，学习实践各类基础生物信息学软件，每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。
主要内容如下：
实习一：基因组数据注释和功能分析
通过序列比对工具BLAST的学习，了解基因功能注释的原理；介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4，掌握系统发生树绘制的基本方法，认识基因复制在进化上的功能；学习基因序列分析常用的数据库和软件。
实习二：R语言数据分析与绘图
介绍转录组数据分析的基本流程及其原理；通过对tophat、cufflinks、R等转录组数据分析工具的介绍及演示，了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法；利用kegg、GOstat、DAVID等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。
实习三：蛋白质结构与功能分析
从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始，接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析，预测目标蛋白的生物功能。
实习四：蛋白质组学数据分析
使用X！Tandem、Mascot、Sequest等软件鉴定蛋白质质谱数据，将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白；使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
实习五：系统生物学软件实习—–网络结构显示与分析
利用Cytoscape系统生物学分析软件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子网络系统，并与基因表达等数据整合。
实习六: 单细胞转录组数据分析实例
研究单个细胞内的基因表达情况，解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实。
实习七：转录组与空间转录组整合分析
从空间层面上解析RNA-seq数据的技术，从而解析单个组织切片中的所有mRNA，从而能够定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达。
三、培训对象
1. 无生物信息学背景，希望了解生物信息学的学员；
2. 计划开展各类组学研究的科研人员；
3. 已有组学数据需了解分析方法的研究人员；
4. 有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。
四、主要师资
于 军 研究员
中国基因组学研究奠基人之一
华大基因研究中心（中国科学院北京基因组研究所）的主要创始人之一
曾担任国家科技部重大科学计划转录组研究首席科学家。多年来致力于基因组学、生物信息学研究、推动测序技术发展。1997年任职于美国华盛顿大学人类基因组研究中心，是早期参与人类基因组计划的唯一华人科学家；1998年回国推动了中国科学家参与人类基因组计划。除了主持 “人类基因组计划北京部分”，又先后主持了“中国杂交水稻基因组计划”、“家蚕基因组计划”、“鸡基因组多态性研究计划”、“中-沙椰枣基因组计划”等多项大型基因组研究计划。先后获得2002年中国科学院“百人计划”(海外杰出人才)、2002年度香港求是科技基金会“求是杰出科技成就奖”、2002年《科学美国人》杂志评首届“年度全球科研领袖”、2003年度“中国科学院杰出科技成就奖”，2012年度“发展中国家科学院农业奖”。目前担任Genes分子遗传学和基因组学专栏 (Section: ‘Molecular Genetics and Genomics’) 的客座编辑。
胡松年 研究员
中国科学院微生物研究所研究员
曾担任中国科学院遗传与发育研究所人类基因组中心总工程师，并作为主要负责人参与和完成了国际人类基因组计划（Human Genome Project）中国卷测序项目。开发基于单细菌水平的宏基因组检测技术与新型建库技术，为宏基因组研究提供精准采样与检测的实验基础；开发对于整体代谢调控网络、微生物群落进化与疾病表型关系的分析工具，为精准医学的应用提供分析手段。围绕微生物组学研究与动、植物、人体多组学数据，构建全息组学研究平台，对不同样本提供前期收集、实验流程的质控方法，进而能够对长期样本进行横/纵向比较。对微生物重要基因及功能元件进行鉴定与挖掘，分析微生物基因组元件的进化与传递机制特征，预测新功能元件，为合成生物学、微生物组、基因组编辑等提供基础数据。
杨 军 教授
教育部新世纪优秀人才支持计划入选者
浙江省“151”人才第二层次入选者、
主要研究通过分子生物学、系统生物学技术研究化学损伤，尤其是DNA损伤应激的分子机制。已发表研究论文150余篇，其中SCI论文100余篇。主持国家重点基础研究计划（973）子课题1项、国家高技术研究发展规划项目（863）1项、科技部国际科技合作专项1项、国家自然科学基金7项及其他省部级项目多项。担任国际环境诱变剂学会（IAEMSG）、亚洲环境诱变剂学会（AAEMS）理事，中国环境诱变剂学会副秘书长、常务理事，致突变专委会主任委员，外事工作委员会主任委员，浙江省毒理学会副理事长。
钟伯雄 教授
浙江大学动物科学学院教授
开展了家蚕丝腺蛋白质组、以及与野蚕后部丝腺的比较蛋白质组学研究，发现蚕茧优质高产主要是核糖体蛋白代谢通路提高；（2）开展了蛋白翻译后修饰研究，明确了与蚕茧优质高产相关的蛋白质磷酸化特征；（3）建立了高效转基因方法，采用TALEN技术在家蚕胚胎时期成功获得基因定点插入研究结果、采用CRISPR-Cas9技术成功突变家蚕重要功能基因，获得稳定遗传突变品种（4）开展了micRNA研究工作，揭示了家蚕丝腺micRNA表达特征。（5）开展了家蚕生物反应器研究，获得了机械性能优良的家蚕蜘蛛复合丝新材料。在JPR、BMC Genomics、IBMB、遗传学报、蚕业科学等国内外杂志发表相关论文160多篇。
陈 铭 教授
浙江大学生物信息学学科带头人
担任浙江省生物信息学学会理事长
长期从事生物信息学与系统生物学方面的科教工作，致力于组学大数据整合与挖掘，非编码RNA生物信息学研究、生物网络建模分析以及精准医学方面的科学研究。共发表学术论文200余篇，Google Scholar H指数43。现曾担任中国系统仿真学会生命系统建模仿真专业委员会副主任委员、中国运筹学会计算系统生物学分会理事会常务理事、中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会理事、中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会委员会委员；教育部“新世纪优秀人才”，浙江省“151人才工程”第一层次。
徐建红 教授
浙江大学作物科学研究所副所长，博士生导师
浙江省作物种质资源重点实验室副主任
主要从事植物分子生物学与基因组学研究，主要的研究方向是基于大数据与基因编辑技术在基因表达的表观调控(DNA甲基化和miRNA)，种子品质性状形成的分子机理，作物转座子分子标记的开发与转座机理研究以及水稻温敏不育系的选育与育性转育机理和基因与基因组的分子进化等。主要研究内容已在PNAS、Genome Research、Molecular Biology and Evolution、PLoS Genetics、Molecular Plant、Plant Journal、Plant Biotechnology Journal等高质量期刊上发表。
张亮生 教授
浙江大学求是特聘教授 博士生导师
围绕观赏植物（花卉）种质资源挖掘和利用、基因组学和功能基因挖掘等方向，开展王莲等睡莲、杜鹃花、月季、百合、鸢尾等我国具资源优势的花卉的基因组学和生物信息学等研究，重点聚焦花卉主要性状形成的关键基因挖掘和利用，如花发育和花色花香等性状，长远目标是开展花卉分子遗传育种以培育花卉新品种。2016年以来，以通讯或第一作者（包括共同）在Nature、Plant Biotechnology Journal、Plant Journal、Molecular Plant等国际著名期刊发表论文近30篇。领导团队在国际上首次解析了睡莲基因组，该重大研究成果于《自然》（Nature）上发表，揭示了早期开花植物的起源和进化特征，发现了蓝色花瓣和花香关键合成基因。
谷红仓 研究员
中科院合肥研究院健康与医学技术研究所二级研究员，博士生导师
2004年博士毕业于美国肯塔基大学；2004年8月至2006年7月在哈佛大学医学院病理系从事博士后工作；2006年7月加入哈佛大学&麻省理工学院博德研究院(The Broad Institute of Harvard and MIT)任研究员I；2013年7月晋升为研究员ll并任职至2018年6月。谷红仓博士在2018年7月到2020年6月期间参加由美国医学遗传专家委员会(American Board of Medical Genetics and Genomics, ABMGG)与美国俄克拉荷马大学医学院联合举办医学遗传学专科资质培训 , 现为ABMGG执业专家。自2018年7月至今，兼职于哈佛大学＆麻省理工学院博德研究院任客座研究员。2020年10月加入中科院合肥研究院。
五、证书发放
六、收费标准：
4800/人（含教材，转账、刷卡、支付宝）
户 名：浙江大学
帐 号：19042201040000014
开户银行：农行杭州市浙大支行紫金港分理处 （汇单上务必写上：培训上机号）
培训发票由浙江大学计财处开具电子票据。
住宿可统一安排，费用自理。
联 系 人：vicolee2021
因本课程天数较多，报名学员因故缺席部分课程，可联系会务组在后续培训班中免费旁听。
本文系作者 @TIMEDOO 原创发布在 肽度TIMEDOO。未经许可，禁止转载。
