广东省微生物研究所发现一批可能对新型冠状病毒 2019-nCoV具有阻断作用的已上市药物
由广东省微生物研究所雍天乔和陈地灵博士领衔的课题小组,就目前武汉爆发的新型冠状病毒2019-nCoV疫情,开展了抗2019-nCoV病毒潜力药物计算机辅助模型筛选研究。武汉病毒肺炎爆发是由新型冠状病毒2019-nCoV感染引起。2019-nCoV胞膜刺突(S)蛋白通过结合ACE2入侵宿主,决定该病毒的宿主亲和性和进入宿主细胞的能力,是预防和治疗药物开发的关键靶标。它含有S1和S2亚基,在病毒胞膜上形成二聚刺突结构。这里,我们采用同源建模的方法模拟了武汉2019-nCoV激活情况下胞膜刺突(S)蛋白结构,明确了它的药物口袋,筛选得到数个可能的阻断剂。武汉2019-nCoV胞膜刺突(S)蛋白结构与其它冠状病毒类似,结合肽段(CTD1,C端结构域1)是其活性位点,是药物和抗体开发潜在的靶点。我们以FDA批准药物分子库为研究对象,以CTD1结构域为活性靶点,采用分子对接的方法,以老药新用的方式得到数个2019-nCoV病毒感染的潜在阻断剂(详细见表1),其中醋酸阿托西班得分最高达到8.09314,建议在2019-nCoV感染肺炎患者临床治疗中予以考虑和关注。研究课题小组后续将继续深入开展针对性的抗2019-nCoV活性测试,为临床研究和治疗提供更加直接的指导。
广东省微生物研究所发现一批可能对新型冠状病毒 2019-nCoV具有阻断作用的已上市药物-肽度TIMEDOO
图1 模拟的2019-nCoV胞膜刺突结构和2019-nCoV与ACE2结合口袋
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图2 分子模拟可视化筛选得到的配体醋酸阿托西班与2019-nCoV结合情况,形成了8个氢键广东省微生物研究所发现一批可能对新型冠状病毒 2019-nCoV具有阻断作用的已上市药物-肽度TIMEDOO
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表1 以FDA已批准化合物库为配体进行分子对接得到的可能具有阻断2019-nCoV与ACE2结合的抑制剂(TOP20)来源:广东省微生物研究所