2022年7月14日,湖南省益阳市资阳区对集中隔离医学观察点隔离人员例行正常核酸检测时,发现省外涉疫地区返资人员一例核酸检测初筛阳性。

7月15日中午,市委市政府向华大智造发出对核酸检测阳性样本进行新冠溯源分析的邀请。受领任务后,华大智造紧急调运最新款DNBSEQ-E5测序仪、新冠溯源ATOPlex建库试剂和工程技术人员驰援益阳市疾控中心。

基因测序设备于7月15日夜间运抵市疾控中心,工程技术人员连夜奋战,装机调试,市疾控中心检测检验人员于当日22时开始对资阳区疾控中心在7月15日早晨采集的样本进行处理、建库、上机测序,7月16日11时许获得测序结果。病毒序列全长覆盖率99.5%,确定分型为BA2.2毒株。

一锤定音!华大智造DNBSEQ-E5助力湖南益阳疾控首次完成新冠病毒溯源-肽度TIMEDOO

图1:益阳市疾控装机的DNBSEQ-E5首次新冠病毒测序过程

此前,国家发改委等四部门联合印发了《“十四五”优质高效医疗卫生服务体系建设实施方案》,方案中指出,国家和重点区域疾病预防控制机构需具备新发传染病病原体、健康危害因素“一锤定音”检测能力和重特大公共卫生事件处置能力。

此次益阳市疾控中心在华大智造基因测序设备加持下,快速准确完成新冠溯源分析,标志着益阳市疾控中心初步具备了对新冠病毒进行基因测序的能力,为益阳市新冠肺炎疫情以及其他传染病的病原体鉴定溯源、应急处置提供了强大的技术支撑。

华大智造基于DNBSEQ技术的新冠病毒靶向测序产品组合,已帮助全国十余省近百家疾控中心进行新冠溯源病毒,为疫情防控工作提供有效依据,全面助力各地新冠病毒鉴定与溯源工作。而采用了微流控测序载片和集成信号采集模块的DNBSEQ-E5快速测序仪,携同ATOPlex RNA多重PCR建库试剂盒套装3.0紧急响应,已连续部署至超过10个新冠疫情热点地区,测序结果表现优异,高效完成新冠溯源。

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图2:华大智造DNBSEQ-E5助力多地新冠溯源工作

目前,基于全新优化加速的DNBSEQ-E5及其快速测序试剂进行SE100测序,最快可在3.5小时内完成从DNB加载至FASTQ文件输出的全流程。测序完成10分钟内输出新冠病毒变异位点基因注释、变异支系鉴别、全长序列,支持移动部署,能够即时响应特殊样本的紧急测序需求,适用于一线海关、疾控等机构。

作为生命科技核心工具缔造者的华大智造,一直深知公共卫生、精准医疗等多个应用领域对于缩短样本周转时间的期待。我们将持续致力于打造更快、更便捷的基因测序仪等生命科学核心设备,为应对快速发现、准确变异跟踪的疫情防控需求提供硬核支撑保障。

编辑:李丽