2018年3月上旬circRNA研究报道汇总-肽度TIMEDOO

本月上旬的circRNA研究文献共计15篇,涉及脂肪肝、肝炎、高血压、狼疮性肾炎、妊娠糖尿病和卵巢子宫癌等12个疾病方向,这些研究为circRNA在各疾病领域的作用机制提供了很好的前期研究基础。在circRNA的技术应用方面,来自德国吉森大学医学院生化所的研究人员构建了人工circRNA分子,可以吸附丙肝细胞中的miR-122,进而阻止HCV病毒蛋白形成,缓解丙型肝炎,下面我们一起了解下该项研究的具体内容。

 

人造circRNA分子阻止丙型肝炎病毒进程

论文题目:Functional sequestration of microRNA-122 from Hepatitis C Virus by circular RNA sponges.

杂志:RNA biology
影响因子:3.9

通讯作者单位:德国吉森大学

 

研究者将丙型肝炎病毒(HCV)引起的肝炎作为研究对象,HCV是一种单链RNA病毒,缺乏5’帽子结构,可通过高度结构化的内部核糖体进入位点IRES启动蛋白翻译,HCV是肝脏细胞特异性病毒,已有研究表明HCV的这种嗜肝细胞特性主要依赖人体内的miR-122分子,HCV病毒基因组5’端存在两个miR-122的结合位点,miR-122可保护病毒RNA免受Xrn-1的核酸外切降解,增强病毒复制和病毒蛋白的翻译,从而促进HCV的繁殖。因此miR-122已成为丙型肝炎药物治疗的主要靶标之一,基于miR-122的锁核苷酸LNA药物已进入二期临床试验。

 

人工circRNA体外设计合成

由于circRNA的环形结构,不存在5’和3’的游离末端,在细胞中的稳定性比线性分子更强,因此研究者考虑将包含miRNA-122结合位点(串联重复)的序列体外人工合成circRNA分子。

2018年3月上旬circRNA研究报道汇总-肽度TIMEDOO

图注:人工构建circRNA序列及T4连接酶成环示意图(A,B),Nothern blot验证体外合成的circRNA分子。人工合成的circRNA即存在细胞质也存在于细胞核中(图E)。

该人工设计的circRNA组成序列,主要包含4个部分,含有miR-122结合位点的8聚体(图A蓝色区段),随机改组的序列(图A灰色区段),红色区段的互补配对茎部序列(利于序列成环),序列前端的T7转录启动子序列和酶切位点。将设计合成好的DNA序列克隆到pCR2.1载体,转录后得到的RNA序列最后用T4连接酶进行连接即可得到合成的circRNA。

CircRNA不仅可以吸附miRNA,还可以吸附结合蛋白,设计结合蛋白的circRNA分子或许更容易实现,可以推测的是人工合成的circRNA可通过隔离miRNA分子抑制病毒的复制,是否也可以隔离有利于病毒扩增的蛋白,进一步抑制病毒进程将是特别有意思研究方向,也为circRNA应用与疾病治疗打开了一扇新的大门。

 

人工circRNA可抑制HCV蛋白翻译

研究者使用非感染性HCV /萤光素酶报道系统,其中HCV多蛋白开放阅读框(ORF)的主要部分被萤光素酶ORF替代,保留HCV核心蛋白编码序列的天然起始密码子和前33nt,维持内部核糖体进入位点的结构。转染HuH-7.5细胞后检测荧光值判断人工circRNA抑制蛋白翻译的作用。

2018年3月上旬circRNA研究报道汇总-肽度TIMEDOO

图注:荧光素酶报告实验显示人工circRNA可一直HCV病毒的翻译。

 

人工circRNA的作用与优势

    最后研究者也阐述了人工circRNA的其他可能应用及优势,为circRNA进入疾病治疗的研究提供了参考方向。

1)外显子来源的circRNA定位在细胞质,人工circRNA可进入细胞核,可作为染色质重塑、转录调控和RNA前体剪切的分子工具;

2)目前开发的miRNA诱饵LNA锁核苷酸药物,由于LNA修饰的特性,在人体聚集不可降解,存在肝脏毒性效益,人工circRNA模拟自然circRNA分子存在代谢途径可避免此效益;

3)人工合成circRNA可以通过多种方法实现,除T4连接酶体外连接,还可以通过tRNA的剪接机制生成或构建通用过表达质粒(如吉赛pCD-ciR系列circRNA过表达载体);

 

文献统计表

2018年3月上旬circRNA研究报道汇总-肽度TIMEDOO
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参考文献见上表。

文 | circRNA 吉赛生物

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