皮肤是人体最大的器官，除了作为外界与生物体之间的屏障，皮肤上还居住着数以百万计的细菌、真菌和病毒。它们共同构成了皮肤微生物群落，如同皮肤上的“小社区”。
与肠道微生物相似，皮肤上的微生物在对抗入侵病原体、训练人体免疫系统以及分解天然产物等方面起到了至关重要的作用。但是，由于皮肤微生物组的生物量低，这大大限制了通过测序技术对微生物物种的全面识别。
近日，华大生命科学研究院通过自研的超低生物量宏基因组测序方案，对450个人体面部样本进行高深度鸟枪法测序，并结合2069个已公开的皮肤微生物组学数据，成功构建了统一的人体皮肤基因组目录。相关研究成果在线发表于国际期刊《先进科学》（Advanced Science）。
华大揭开人体皮肤微生物组的神秘面纱，或助力皮肤疾病诊疗-肽度TIMEDOO
Advanced Science截图
该目录涵盖了来自22个皮肤部位的813个原核生物物种和5779个微生物组装基因组。其中，有470个为新物种（覆盖20个门），1385个为新的组装基因组。
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通过这个目录，研究团队描述了皮肤微生物组的核心功能，并鉴定了不同类型微生物在氨基酸代谢、碳水化合物代谢和耐药性（有助于抗生素在皮肤病中的使用）上的差异。通过对近乎完整基因组的潜在代谢功能分析，团队发现了1220个潜在的新型次级代谢物，其中一些在新的基因组中发现。
研究还通过单核苷酸变异揭示了皮肤一种可能的保护机制——皮肤中的假单胞菌、Bosea spp.和Microbacter spp. 等条件致病菌（即原先不致病的正常菌群，若平衡关系被打破，可能发展成为致病菌）更倾向于稳定选择，从而降低产生更多毒性菌株的可能性。
文章共同第一作者、华大生命科学研究院李志明博士表示，“这个基因组目录具有重要的科学意义和潜在的临床应用价值，将为我们深入了解皮肤微生物的作用提供便利。比如，某些微生物物种对药物具有抗性，这对治疗皮肤疾病具有重要意义。同时，皮肤微生物组的研究也将帮助我们进一步理解皮肤健康和疾病的关系，为开发新型皮肤护理产品提供指导。”
此外，这项研究也揭示了人体皮肤微生物组的巨大潜力。未来，随着人们对人体微生物组的了解愈加深入，相关研究将有望取得更多突破，为我们提供更好的健康保护和疾病治疗方案。
华大生命科学研究院精准健康研究所主任科学家聂超和郭锐进副研究员为该论文共同通讯作者，李志明博士和鞠艳梅为论文共同第一作者。

编辑：李丽