近日，位于Reichman大学Dina Recanati医学院的Scojen合成生物学研究所宣布推出全球最大的人类癌症及其他慢性疾病中的嵌合基因（基因融合）数据库——ChiTaRS 8.0。该项目由Genomics and Computational Biology实验室负责人、Frenkel-Morgenstern博士领衔，巴伊兰大学Azrieli医学院的博士生Dylan D'Souza和Olwumi Giwa共同参与。此项研究的成果已在《核酸研究》期刊上发表，标志着嵌合基因研究领域的重大进展，为癌症治疗的个性化方案制定提供了强有力的支持。
基因融合是指不同基因的片段结合在一起，这一现象对癌症肿瘤的发展具有重要影响。基因融合产生的异常蛋白质往往是疾病诊断的重要标志，也可能成为新药开发的潜在靶点。ChiTaRS 8.0数据库目前包含超过47,000个RNA转录本和10万多个在人类中识别的嵌合序列，为科学家提供了丰富的研究数据。
该数据库的一个突出特点是与“数字化医院”模型的结合，能够实时更新并纳入新的临床数据。这一功能使得医生能够根据患者的基因信息，设计个性化的癌症治疗方案，提高治疗的精准性和效果。
此外，ChiTaRS 8.0数据库还为新药研发提供了革命性的工具。通过与DGIdb数据库的数据整合，科学家可以研究融合蛋白与现有药物（如靶向癌症促进蛋白的抑制剂）之间的相容性，为未来的药物开发提供参考。
Scojen合成生物学研究所所长Yosi Shaham-Diamand教授表示：“该数据库还被开发为预测肿瘤对治疗反应的工具，有助于提高治疗成功率并减少副作用。除了对全球研究的贡献外，ChiTaRS 8.0还将促进全球研究机构间的合作，未来将整合更多复杂数据集并引入人工智能技术。”
Frenkel-Morgenstern博士指出：“这个数据库是癌症理解和治疗的一个重要进步。它是一个动态的研究工具，旨在改变癌症诊断和治疗的面貌。我们还计划添加FDA批准的药物信息，这些药物能够与嵌合蛋白结合，并结合嵌合基因的表达水平，开发定制化的生物标志物，以推动精准医学的发展。”
ChiTaRS 8.0的推出为癌症研究和治疗带来了新的可能，也为全球医学和生物学研究领域提供了重要的资源和平台。
参考文献：Dylan DSouza et al, ChiTaRS 8.0: the comprehensive database of chimeric transcripts and RNA-seq data with applications in liquid biopsy, Nucleic Acids Research (2024). DOI: 10.1093/nar/gkae1126
编辑：王洪
排版：李丽
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