《Nature Cell Biology》：肿瘤相关巨噬细胞细胞外囊泡包裹的lncRNA调节乳腺癌细胞的有氧糖酵解

IF：19.064

2019-4-1

代谢重编程是癌症的重要特征。中山大学孙逸仙纪念医院的研究人员证明了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）通过细胞外囊泡（EV）传递一种骨髓特异性lncRNA HISLA（HIF-1α-stabilizing long noncoding RNA），从而增强乳腺癌细胞的有氧糖酵解和细胞凋亡抗性。机制上，HISLA可阻断PHD2与HIF-1α的相互作用以抑制HIF-1α的羟基化和降解。反过来，处于糖酵解状态的肿瘤细胞释放的乳酸可显著上调巨噬细胞中的HISLA，构成TAMs和肿瘤细胞之间的前馈环路。阻断细胞外囊泡（EV）传递HISLA可抑制体内乳腺癌的糖酵解和化学抗性。临床上，TAMs中的HISLA表达与糖酵解、化疗反应差和乳腺癌患者生存期短有关。该研究强调了lncRNAs作为信号转导物的潜力，这些信号转导物通过EV在免疫细胞和肿瘤细胞之间传播，以促进癌症有氧糖酵解。
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Fig1. Graphical illustration of the interaction between TAMs and breast cancer cells.
原文：Chen F, Chen J N, Yang L B, et al. Extracellular vesicle-packaged HIF-1α-stabilizing lncRNA from tumour-associated macrophages regulates aerobic glycolysis of breast cancer cells[J]. Nature Cell Biology, 2019.

《Nature Communication》：TRIM71与lncRNA Trincr1结合抑制胚胎干细胞中的FGF/ERK信号传导

IF:12.353

2019-3-25

长链非编码RNAs（lncRNAs）已成为胚胎干细胞（ESCs）中基因调控网络的重要组成部分。然而，lncRNAs的功能和分子机制在很大程度上仍然未知。北京大学分子医学研究所的研究人员确定了一个lncRNA Trincr1（TRIM71相互作用的长链非编码RNA 1），其可调节ESCs的FGF/ERK信号传导和自我更新。Trincr1通过THOC复合物进入到细胞质中，在那里它结合并抑制TRIM71，导致SHCBP1蛋白的下调。敲除Trincr1会导致ERK磷酸化和ERK通路靶基因的上调，以及ESC自我更新的减少，然而敲除Trim71完全挽救了Trincr1敲除的缺陷。此外，Trincr1的异位表达抑制FGF/ERK信号传导和神经祖细胞（NPCs）的自我更新。总之，该研究强调lncRNA是细胞信号网络中协调细胞命运规范的重要参与者。
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Fig2. Ectopic expression of Trincr1 represses FGF/ERK signaling in NPCs.
原文：Li Y P, Duan F F, Zhao Y T, et al. A TRIM71 binding long noncoding RNA Trincr1 represses FGF/ERK signaling in embryonic stem cells[J]. Nature Communications, 2019, 10(1): 1368.

《The EMBO Journal》：长链非编码RNA ROCKI调控炎症基因表达

IF：10.557

2019-3-27

长链非编码RNAs（lncRNAs）可通过顺式（局部）或反式（非局部）作用调节靶基因表达。加州大学圣地亚哥医学院的研究人员对Toll样受体（TLR）刺激的人类巨噬细胞进行了全基因组表达分析，以鉴定参与先天免疫的顺式作用lncRNA和蛋白编码基因对。总共鉴定出229个基因对，其中许多基因对通过多种TLRs信号通路调控，参与B组链球菌感染的细胞因子反应。该研究专注于阐明一个lncRNA的功能，命名为lnc-MARCKS或ROCKI（细胞因子和炎症的调节因子），它是由多种TLR刺激诱导并充当炎症反应的主要调节因子。ROCKI与APEX1（脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1）相互作用以在MARCKS启动子处形成核糖核蛋白复合物。反过来，ROCKI-APEX1募集了组蛋白去乙酰化酶HDAC1，其从启动子中去除了H3K27ac修饰，从而降低了MARCKS转录以及随后的Ca2+信号传导和炎症基因表达。最后，影响ROCKI表达的遗传变异与人类某些炎症和传染病的风险降低有关，包括炎性肠病和结核病。总之，这些数据强调了顺式作用lncRNA在TLR信号传导，先天免疫和病理生理炎症中的重要性。
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Fig3. A cis-regulatory model for ROCKI function in the negative regulation of MARCKS in innate immune cells.
原文：Zhang Q, Chao T C, Patil V S, et al. The long noncoding RNA ROCKI regulates inflammatory gene expression[J].The EMBO Journal, 2019: e100041.

《PNAS》：抑制lncRNA SAF可激活HIV-1感染的人类巨噬细胞中的凋亡效应因子caspases

IF：9.504

2019-3-27

长链非编码RNAs (lncRNAs)在多种生物通路中具有重要的调节功能，并且通过调控这些RNAs可提供一个重要的途径来调节这些通路，尤其是在疾病中。目前对于lncRNAs在HIV-1感染期间决定细胞命运方面的作用仍然知之甚少。康奈尔大学的研究人员确定了lncRNA SAF在调节巨噬细胞凋亡效应因子caspase中的影响。与对照细胞相比，HIV-1感染的人类单核细胞衍生的巨噬细胞（MDM）中的SAF表达显著上调。在HIV-1感染个体支气管肺泡灌洗获得的HIV-1感染的气道巨噬细胞中也检测到SAF RNA表达的类似增强。用siRNA下调SAF的表达水平可增加病毒感染MDMs中caspase-3/7的活性水平。这种凋亡caspases的诱导仅发生在HIV-1感染的巨噬细胞中，导致巨噬细胞培养物中HIV-1复制和总病毒负荷的显著减少。该研究确定了靶向lncRNA SAF作为特异性诱导HIV-1感染巨噬细胞细胞死亡的潜在手段。
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Fig4. Effect of siSAF treatment on apoptosis of HIV-1–infected MDMs.
原文：Boliar S, Gludish D W, Jambo K C, et al. Inhibition of the lncRNA SAF drives activation of apoptotic effector caspases in HIV-1–infected human macrophages[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2019: 201818662.

《Genes & Development》：lncRNA Falcor调控Foxa2的表达以维持肺上皮细胞稳态并促进再生

IF：9.462

2019-3-28

转录因子（TF）是基因表达剂量敏感的主要调节因子，单倍剂量不足经常会导致危及生命的疾病。许多机制已经发展到在转录、翻译和翻译后水平上严格调控TFs的表达和活性。长链非编码RNAs（lncRNAs）在空间上与基因组中的转录因子相关，但这些lncRNAs与其邻近的TFs之间的调节关系尚不清楚。辛辛那提大学的研究人员在TF Foxa2和下游lncRNA Falcor (Foxa2相邻的长链非编码RNA)之间确定了一个调节反馈回路。Foxa2通过与其启动子结合直接抑制Falcor的表达，而Falcor以顺式作用正向调节Foxa2的表达。在肺部，Falcor的缺失足以导致气道上皮损伤后的慢性炎症改变和修复缺陷。此外，Falcor-Foxa2调节反馈回路的破坏导致细胞黏附和迁移的改变，进而导致慢性支气管周围气道炎症和杯状细胞化生。这些数据表明，lncRNA Falcor在调节反馈回路中发挥作用，微调Foxa2的表达，维持气道上皮稳态，促进再生。
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Fig5. Model for Falcor regulation of Foxa2.
原文：Swarr D T, Herriges M, Li S, et al. The long noncoding RNA Falcor regulates Foxa2 expression to maintain lung epithelial homeostasis and promote regeneration[J]. Genes & Development, 2019.

《Cancer Immunol Res》：假基因Olfr29-ps1促进单核细胞MDSC的抑制功能和分化

IF：9.188

2019-3-26

长链非编码RNA（lncRNA）在细胞分化和发育等许多生物学过程中发挥着重要作用。然而，关于lncRNA调节骨髓来源的抑制性细胞（MDSCs）分化和发育的研究却很少。南开大学医学院的研究人员确定了一种lncRNA假基因Olfr29-ps1，它在MDSCs中表达并被促炎细胞因子IL6上调。脊椎动物中的Olfr29-ps1序列是保守的，Olfr29-ps1和人类OR1F2P序列之间的相似性为43％。该lncRNA在体内外促进单核细胞（Mo-）MDSCs的免疫抑制功能和分化。它直接吸附miR-214-3p以下调miR-214-3p，其可以靶向MyD88以调节MDSC的分化和发育。Olfr29-ps1的功能依赖于IL6介导的N6-甲基腺苷（m6A）修饰，不仅增强了Olfr29-ps1，而且促进了Olfr29-ps1与miR-214-3p的相互作用。因此，研究结果证明假基因Olfr29-ps1可通过m6A修饰的Olfr29-ps1/miR-214-3p/MyD88调控网络调节MDSC的分化和功能，揭示了骨髓细胞调控的机制，并为抗肿瘤免疫治疗提供了潜在的靶点。
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Fig6. Olfr29-ps1 promotes differentiation and suppressive function of MDSCs in vivo.
原文：Shang W, Gao Y, Tang Z, et al. The Pseudogene Olfr29-ps1 Promotes the Suppressive Function and Differentiation of Monocytic MDSCs[J]. Cancer Immunology Research, 2019: canimm. 0443.2018.

《Cancer Research》：lncRNA MALAT1通过增强mTOR介导的TCF7L2翻译来调节癌症葡萄糖代谢

IF：9.13

2019-3-26

葡萄糖代谢重编程促进有氧糖酵解（或Warburg效应）被称为是癌症的一个标志。长链非编码RNA（lncRNA）在糖酵解和糖异生水平上调节癌症代谢的作用大多是未知的。之前的研究表明，lncRNA转移相关肺腺癌转录物1（MALAT1）在肝细胞癌（HCC）中起原癌基因的作用。以色列希伯来大学哈达萨医学院的研究人员研究了MALAT1在调节癌症葡萄糖代谢中的作用。发现MALAT1通过增强代谢转录因子TCF7L2的翻译来上调糖酵解基因的表达和下调糖异生酶的表达。MALAT1增强的TCF7L2翻译是通过上调SRSF1和激活mTORC1-4EBP1轴来介导的。mTOR和Raptor的药理学或遗传抑制，或者eIF4E结合蛋白（4EBP1）的低磷酸化突变形式的表达导致了TCF7L2表达的降低。MALAT1的表达调节了TCF7L2 mRNA与重多核糖体的关联。在MALAT1过表达细胞和HCC细胞系中敲低TCF7L2影响了其代谢并消除其致瘤潜力，表明MALAT1对葡萄糖代谢的作用对其致癌活性至关重要。总之，研究结果表明，MALAT1通过重编程肿瘤葡萄糖代谢促进HCC发展和肿瘤进展。
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Fig7. Scheme summarizing the role of MALAT1 in regulating glucose metabolism in HCC.
原文：Malakar P, Stein I, Saragovi A, et al. Long Noncoding RNA MALAT1 regulates cancer glucose metabolism by enhancing mTOR-mediated translation of TCF7L2[J]. Cancer Research, 2019: canres. 1432.2018.
来源：锐博生物
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