耶鲁研究:基因检测中的“不确定变异”或隐藏重要线索-肽度TIMEDOO

在许多未解的医学难题背后,患者渴望得到明确的答案与有效的治疗。对于怀疑患有先天性免疫缺陷(Inborn Errors of Immunity, IEIs)的患者而言,基因检测能够为个体化诊疗提供新方向。然而,检测结果并非总能带来清晰的答案。许多患者最终被告知存在意义未明的基因变异(Variants of Uncertain Significance, VUS)——科学家能够检测到这些DNA变化,但目前缺乏足够证据判断其有害或无害。

近日,耶鲁大学医学院(Yale School of Medicine, YSM)研究团队在 Clinical Immunology 期刊发表的新研究指出,这些“不确定变异”并非应被一概搁置,而可能蕴含重要的临床线索。

该研究的通讯作者、耶鲁大学医学院风湿病学、过敏与免疫学助理教授,同时也是耶鲁医学免疫缺陷项目主任的Junghee Jenny Shin医学博士、哲学博士介绍,大约80%的IEI患者在基因检测中会得到VUS结果,这一结论常令患者倍感挫败。IEI患者自出生起便存在免疫系统缺陷或功能异常,往往会经历反复或严重感染、自身免疫病、炎症性疾病,甚至某些癌症。

“传统指南要求医生不能依据VUS进行治疗,所以大多数情况下我们会把这些结果搁置。”Shin表示,“但临床上我们常发现,这些变异与患者的表现存在对应关系。这让我们思考,是否有更有价值的分类方式能够帮助医生和患者。”

在这项研究中,第一作者、耶鲁医院住院医师Samantha Novotny医学博士收集并整理了患者的遗传学、免疫学和临床资料,并建立了数据库。研究团队在其中识别出200多个VUS,并按照基因功能进行聚类。结果显示,不同功能基因的VUS与患者的具体临床表现存在一定关联性。

其中最强的相关性出现在与适应性免疫系统相关的VUS:

  • B细胞相关VUS:患者更容易出现反复呼吸道感染,并常常需要接受免疫球蛋白替代治疗。

  • T细胞相关VUS:患者更倾向于出现免疫系统过度活跃及自身免疫性问题,这与T细胞在调控免疫反应中的作用相符。

这是首个在IEI患者中通过聚类方式分析VUS并寻找其临床联系的研究。过去大多数相关研究侧重于功能实验,即在实验室中直接编辑候选基因以验证某一变异的影响。

Shin强调:“功能实验仍是金标准,但在日常临床中难以操作。我们的研究并不能替代功能验证,也不能直接定义某个变异的临床意义。但通过整体分析,我们能够发现值得进一步探索的模式,从而更接近为患者找到更合适的治疗方案。”

这项研究汇聚了耶鲁医学院多个部门的力量,尤其是临床过敏与免疫学团队的跨学科合作。Shin表示:“这是一次真正的团队努力。我们将临床中的疑问转化为研究中的洞见,这不仅推动了科学探索,也让我们更接近理解和帮助患者。”

参考文献:Samantha Novotny et al, Association of clinical manifestations and immune alterations with genetic variants of uncertain significance in patients concerned for inborn errors of immunity, Clinical Immunology (2025). DOI: 10.1016/j.clim.2025.110513

编辑:周敏

排版:李丽