新技术可以提高DNA的成像效果

最近，科学家开发了一种快速，简单的样品制备方法，可以增强DNA的成像效果，从而更好地分析其物理性质和相互作用。

根据在《ACS Nano》杂志中发表的这项研究，作者将DNA与云母（一种扁平硅酸盐矿物）结合。这个过程扩展了DNA。因此与以前的方法相比，可以分析的分子数量达到了8倍。

（图片来源：Heenan/JILA）

液体中扩展结构的原子力显微镜（AFM）成像改善了DNA的生物物理数据的质量和数量及其与蛋白质的相互作用。该方法在很宽的盐浓度范围内产生高质量的图像。高分辨率图像显示DNA的标志性双螺旋结构，看起来像一个扭曲的梯子。

“我们希望这种新的样品制备方法能够为调节DNA与表面的结合强度铺平道路，这有助于研究蛋白质-DNA复合物的动力学，”作者说道。

DNA的AFM成像先前已经在空气和液体中进行了研究，但是对于液相中DNA的制备，此前没有广泛接受的方法。云母是一种十分有潜力的基质，它表面平坦。虽然带有负电荷，会排斥DNA，但是经过处理之后这一问题也能够得到解决。

在该研究中，作者首先将云母浸泡在镍盐溶液中，温和漂洗和干燥，以及在含有氯化镁和氯化钾的溶液中将DNA与云母结合。这些盐条件保留了与DNA结合的蛋白质的特性。在蛋白质-DNA复合物与云母结合后，成像前的最后一步包括用含有氯化镍的溶液冲洗云母，该溶液通过增加DNA-云母相互作用强度来捕获DNA结构。

这种方法首次在液体中产生了与平坦表面结合的DNA的AFM图像，而不会改变其众所周知的机械性能，包括其宽度，长度和天然骨架刚度。科学家使用这种新方法制作高质量的DNA图像和两种蛋白质-DNA复合物。 DNA蛋白复合物的增强图像将帮助研究人员了解DNA修复和细胞代谢等过程的新细节。

来源：生物谷

资讯出处：Five-minute sample processing enhances DNA imaging and analysis

原始出处：Patrick R. Heenan, Thomas T. Perkins. Imaging DNA Equilibrated onto Mica in Liquid Using Biochemically Relevant Deposition Conditions. ACS Nano, 2019; DOI: 10.1021/acsnano.8b09234