2018年5月下半月circRNA研究报道汇总

欢迎大家来到circRNA研究报道汇总，往期汇总文章可在本公众号“近期文章”栏目中查阅，接下来我们一起浏览5月下半月circRNA研究有哪些进展。

1、 circRNA从胞核中释放出的机制研究

论文题目：A length-dependent evolutionarily conserved pathway controls nuclear export of circular RNAs

杂志：Genes Dev
影响因子：9.431分

通讯作者单位：佩雷尔曼医学院

本文研究者来自宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院，他们重点关注了circRNA的转录后出核机制，这方面的研究还非常少，但并不意味着不重要，通过观测circRNA的出核和细胞定位机制，可以帮助更好地理解circRNA的功能和分子机制。研究者通过果蝇shRNA筛选模型，发现Hel25E是介导circRNA转录后出核的重要调控因子，随后在人中找到了Hel25E的同源蛋白UAP56 (DDX39B) 和URH49 (DDX39A)同样可介导circRNA的出核，意味该现象可能是一种普遍机制，进一步研究发现一个有趣的现象，circRNA出核受circRNA本身序列长度的影响。本文的具体解读可参看我们公众号“重磅！circRNA出核机制取得重大进展”的微信文章。

图1：circRNA（长/短序列）出核分子机制示意图（Hopper AK,et al.2018. Genes Dev）

2、 circRNA在Twist1调控肝癌转移EMT过程中机制研究

论文题目：Twist1 regulates Vimentin through Cul2 circular RNA to promote EMT in hepatocellular carcinoma

杂志：Cancer Res
影响因子：9.122

通讯作者单位：南开大学

以往研究表明Twist是肿瘤转移EMT过程中的非常重要转录因子之一，它可以上调波形蛋白Vimentin蛋白的表达，进而促进肿瘤发生上皮间质转化（EMT），但其中具体机制尚不清楚。Twist转录因子可以结合Cul2基因的启动子区域选择性激活Cul2—circRNA（circ-10720）的表达，但不影响cul2 mRNA的表达水平。circ-10720与Twist表达水平、肝癌恶性程度正相关，circ-10720可通过吸附靶向vimentin蛋白的miRNA，提高vimentin的蛋白表达水平，敲低circ-10720后可抵消Twist促进肝癌发展的进程。TetOn-Twist1转基因小鼠模型中同样观测到这种现象。该研究表明了circRNA在肿瘤EMT过程中的重要作用，也揭示了Twist上调Vimentin蛋白促进肝癌转移的分子机制，为肝癌的治疗了提供了潜在的分子靶标。

图2：circ-10720在Twist1调控肝癌转移EMT过程中分子机制模式图

3、circIRAK3通过吸附miR–3607促进乳腺癌转移

论文题目：CircIRAK3 sponges miR-3607 to facilitate breast cancer me tastasis

杂志：Cancer Lett
影响因子：6.375

通讯作者单位：南京医科大学

肿瘤转移是肿瘤致死的重要因素之一，揭示其分子机制，遏制肿瘤转移一直是医学科研的重要任务，但肿瘤转移过程中涉及的分子机制异常复杂，本文研究者主要关注circRNA在乳腺癌转移过程中的分子功能机制。研究者发现circIRAK3在乳腺癌转移细胞中异常高表达，体外功能获得性和缺失性研究发现，circIRAK3可促进乳腺癌细胞的转移和侵袭，但不影响细胞增殖。RNA免疫沉淀和荧光素酶报告基因实验表明circIRAK3可通过吸附miR-3607,下调其表达，进一步研究表明circIRAK3/miR-3607的下游靶基因为FOXC1，而FOXC1进一步可结合到IRAK3的启动子区域，形成正反馈回路，维持circIRAK3/miR-3607/FOXC1通路的持续激活。该研究为乳腺癌的转移治疗提供了潜在新的circRNA治疗靶标。

图3：circIRAK3通过miRNA sponge功能调控FOXC1的表达

4、人喉鳞状细胞癌中circRNA的RNA-seq表达谱

论文题目：RNA-Seq profiling of circular RNAs in human laryngeal squamous cell carcinomas

杂志：Mol Cancer
影响因子：6.204

通讯作者单位：北京友谊医院

人喉鳞状细胞癌LSCC是起源于喉黏膜上皮组织的恶性肿瘤，是头颈部肿瘤中恶性程度非常强的肿瘤，世界范围内每年发生率占比2.4%，近年内还有逐渐增加趋势。CircRNA作为一种新兴的分子，在人体各组织中均有特异表达，参与机体的各类生理病理过程，本研究主要关注circRNA在LSCC疾病中的表达情况，通过RNA-seq高通量测序技术，研究者观测分析了10例LSCC患者临床标本（2例高分化、3例为中分化、 5例正常）中的circRNA表达情况。共鉴定出21444个circRNA，其中在LSCC中显著上调的circRNA 29个，显著下调circRNA 19个，进一步结合临床特征（高分化，中分化和正常）进行分类，将差异表达circRNA缩小到18个和5个。CircRNA-miRNA-mRNA调控网络预测分析，发现20个失调控circRNA与多种肿瘤相关的miRNA相关，信号通路KEGG富集分析发现，过氧化物酶体PPAR、轴突导向、Wnt和细胞周期通路与LSCC密切相关。随后的qPCR验证结果显示，circ:chr20:31876585–31,897,648可以很好区分LSCC标本和正常标本，表明circRNA作为LSCC潜在理想标志物。

图4：LSCC样本中circRNA差异表达谱

文献列表

文 | circRNA 吉赛生物

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