Parse Biosciences的GigaLab与Vevo Therapeutics携手合作，成功生成了迄今为止最大的单细胞数据集Tahoe-100M。该数据集包含1亿个细胞，涵盖了60,000种条件、1,200种药物处理以及50种肿瘤模型。Vevo计划利用这一数据集推动其基于人工智能（AI）的药物研发进程。
此次合作整合了Parse的单细胞RNA测序技术以及Ultima Genomics的高通量测序功能，整个项目在约一个月内完成。
Vevo联合创始人兼首席科学官Johnny Yu博士表示：“这个数据集对于Vevo团队和Mosaic平台而言是一个重要的里程碑。”Mosaic平台能够大规模生成高分辨率的体内数据，精准测量药物对数百位患者细胞的影响，并捕获基因表达变化的数百万个数据点。
据Vevo首席执行官兼联合创始人Nima Alidoust介绍，Tahoe-100M数据集完全由对病变细胞的扰动实验生成，其规模是目前所有公开的药物扰动单细胞数据的50倍。Vevo希望通过AI工具解析这些信息，从而发现药物与疾病路径之间的关键联系，为新疗法的开发提供可能性。然而，药物开发面临的主要挑战之一是获取足够多的数据来训练AI模型，而Tahoe-100M数据集则为此提供了强有力的支持。
Vevo联合创始人、加州大学旧金山分校副教授及Arc研究所核心研究员Hani Goodarzi博士指出：“Tahoe-100M彻底改变了游戏规则，使我们能够训练更大规模的AI模型，从而更好地理解细胞的语言。”
Vevo计划将单细胞数据与AI模型相结合，探索主要癌症亚型的新靶点和通路，并筛选针对这些通路的药物化合物。Yu博士补充道：“过去两年中，我们不断优化平台，而借助Parse GigaLab的支持，我们现已能够以极高的速度和规模生成驱动AI药物发现所需的数据。”
Vevo还计划在明年第一季度围绕该数据集宣布更多合作项目。
与此同时，此次合作也展示了Parse的Evercode技术在GigaLab中的优势，尤其是在速度、质量和大规模扩展能力方面的表现。Parse联合创始人兼首席执行官Alex Rosenberg表示，GigaLab是Parse今年推出的一项创新计划，专注于支持单细胞数量超过1,000万的研究项目，适用于多个领域。在GigaLab启动时，Parse曾声称其年处理能力达25亿个单细胞，并计划在未来进一步扩展。
除了与Vevo的合作外，Parse还在探索其他可能利用GigaLab单细胞测序能力的大型项目，包括与生物制药公司及大型科研联盟的合作。
参考资料：https://www.genengnews.com/topics/artificial-intelligence/ai-drug-discovery-dataset-tops-100m-cells-in-vevo-parse-partnership/
编辑：周敏
排版：李丽
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