
美国莱斯大学的研究人员建立了一套新的药物筛选流程:先确定有效药物应当具备哪些功能,再用机器学习从400多万种化合物中反向挑出候选者。借助这一流程,他们既找到了一批针对急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)的潜在药物分子,也发现了一个AML细胞特有的新药物靶点。相关论文近日发表于Leukemia。
癌细胞的行为方式与健康细胞不同,它具备一些独特性状,使其能够快速增殖并绕过质量控制。莱斯大学生物科学教授、论文通讯作者Natasha Kirienko希望找出这些独特之处,并加以利用来推进癌症治疗。此次研究中,她的团队用新的筛选方法寻找能够针对癌细胞这些独特弱点、又不会过度伤害健康细胞的药物。
"我们开发了一种筛选方法,用于寻找抗急性髓系白血病的潜在药物。"Kirienko说,"这一方法借助机器学习,实质上是把传统药物筛选的思路倒过来做。凭借它,我们不仅找到了新的潜在药物化合物,还找到了一个AML细胞特有的新药物靶点。"
具体做法是,研究团队先从以往实际在实验室里针对AML细胞开展的筛选中挑出那些有效的药物,确定只在这些有效药物身上出现的三项功能,再用基于机器学习的软件挑选最可能具备这三项功能的化合物。该程序能够对400多万种药物化合物给出预测,其中符合筛选标准的不足100种。
"我们要找的化合物需要做到:增加细胞死亡即凋亡;增加细胞器的回收利用即自噬;以及抑制一种名为谷胱甘肽还原酶的蛋白。"论文共同作者、研究生Bernadetta Meika说,"我们的计算模型识别出略少于100个能够完成这些功能的分子。我们挑出其中最好的20个拿到实验室去测试。"
团队进一步考察谷胱甘肽还原酶时发现,抑制这种蛋白正好利用了癌细胞的一个特定弱点。白血病细胞能量需求高,因而高度依赖细胞的"动力工厂"线粒体。线粒体在产生能量的同时,也会产生有害的活性氧(reactive oxygen species,ROS),这些活性氧一经产生就必须被中和。谷胱甘肽还原酶是中和过程中的关键一环,一旦被抑制,细胞中和活性氧的能力就会显著下降。
在健康细胞中,次级的中和途径可以弥补谷胱甘肽还原酶被抑制带来的缺口。但在AML细胞中,高能量需求意味着产生的活性氧超出了细胞备用途径的处理能力,过量的活性氧先损伤细胞,继而将其杀死。
"在典型的计算机模拟(in silico)筛选过程中,研究者会明确告诉程序要针对什么。"Meika说,"而在这个过程中,我们让它去寻找的是一些功能,这些功能既帮我们识别出潜在药物,也让我们得以定义一个靶点。"
团队随后在AML细胞系和AML患者捐献的癌细胞中测试了排名靠前的化合物,发现这些化合物能够选择性地作用于AML细胞。他们还把新化合物与现有AML药物联用,结果显示出协同效应:联用方案杀死了高达95%至97%的癌细胞,而对健康血细胞的杀伤只有5%。
"与化学家、生物学家、计算生物学家和临床医生的合作,使我们得以建立这条流程,并找到一个有潜力的新靶点和相应的候选药物。"Kirienko说,"现在,我们可以用这条流程去其他癌症中寻找新的化合物和靶点。"
这项工作的主要合作者包括休斯敦大学药物化学家Scott Gilbertson,以及得克萨斯大学MD安德森癌症中心的Simona Colla和Steven Kornblau——后两位还为研究提供了该中心白血病样本库中患者样本的使用渠道。
参考文献:Megan R. Daneman et al, Cheminformatic identification of small molecules targeting acute myeloid leukemia, Leukemia (2026). DOI: 10.1038/s41375-026-03104-z
编辑:王洪
排版:李丽





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