9月下半月circRNA研究报道汇总

欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献22篇，下面我们一起来看看circRNA研究有哪些新进展。

1、源自EML4-ALK融合基因的环状RNA F-circEA-2a促进非小细胞肺癌细胞迁移和侵袭

论文标题Circular RNA F-circEA-2a derived from EML4-ALK fusion gene promotes cell migration and invasion in non-small cell lung cancer

杂志：Mol Cancer. 影响因子：7.776

通讯作者单位：四川大学华西医院

NSCLC非小细胞肺癌约占肺癌中85%，NSCLC往往确诊既是中晚期，5年生存率极低。NSCLC中通常存在原癌基因样的融合基因，如EML4-ALK融合基因占NSCLC比例约4%-5%，EML4-ALK融合蛋白可激活ALK相关原癌基因信号通路促进NSCLC发展，研究者前期发现EML4-ALK基因剪接体3b可产生一种融合的circRNA，F-circEA-4a可以促进肿瘤发生发展。该研究中发现EML4-ALK产生的另一种融合circRNA，F-circEA-2a拼接位点处包含“AA”motif（F-circEA-4a是“AAAA”），F-circEA-2a主要定位在细胞质促进肺癌细胞转移和侵袭，对细胞增殖影响不大。F-circEA-2a主要在NSCLC患者组织中，而不存在患者血液中，也突出了F-circEA-4a在体液筛查中作为标志物的潜力。

目前融合基因产生的融合circRNA文章并不多，相信不久将来会发现更多有意思的融合circRNA分子。Cell杂志报道的融合circRNA文献解读可参看文章：cell杂志：融合环状RNA文献解读

图注：F-circEA-2a在NSCLC中的鉴定，a：F-circEA-2a起源于EML4-ALK基因的事宜图；b：RT-PCR和sanger测序验证F-circEA-2a的拼接位点；c：斑点印迹和qPCR实验鉴定F-circEA-2a和4a在H2228细胞中的表达情况；d：qPCR实验分析F-circEA-2a/4a在H2228细胞质和细胞核中的表达比例。

2、环状RNA hsa_circ_0008305（circPTK2）通过控制非小细胞肺癌中的TIF1γ抑制TGF-β诱导的上皮-间质转化和转移

论文题目：Circular RNA hsa_circ_0008305 (circPTK2) inhibits TGF-β-induced epithelial-mesenchymal transition and metastasis by controlling TIF1γ in non-small cell lung cancer.

杂志：Mol Cancer 影响因子：7.776

通讯作者单位：苏州大学医学院

在非小细胞肺癌（NSCLC）中，TGF-β通过诱导上皮-间质转化（EMT）来促进肿瘤侵袭和转移。现有研究表明环状RNA（circRNA）是涉及人类癌症的非常重要的一类RNA分子。然而，circRNA是否以及如何促成TGF-β诱导的EMT和NSCLC转移仍然模糊不清。该研究发现hsa_circ_0008305（circPTK2）在TGF-β诱导的EMT和肿瘤转移中，circPTK2和转录中间因子1γ（TIF1γ）之间互作发挥调控作用。研究结果表明：CircPTK2和TIF1γ在经TGF-β诱导的EMT的NSCLC细胞中显着下调。CircPTK2过表达则可增加TIF1γ表达，抑制TGF-β诱导的EMT和NSCLC细胞侵袭能力，而circPTK2敲低则具有相反的作用。CircPTK2可海绵样吸附miR-429 / miR-200b-3p，而miR-429 / miR-200b-3p则可通过靶向TIF1γ促进TGF-β诱导的EMT和NSCLC细胞侵袭。CircPTK2过表达显着降低了Snail的表达，Snail是TGF-β/ Smad信号传导的重要下游转录激活因子。在体内转移模型实验中，circPTK2过表达可抑制NSCLC细胞转移。此外，人NSCLC组织中circPTK2表达显著下调与TIF1γ表达正相关。特别是，转移性NSCLC组织中circPTK2显著性低于非转移组织。研究结果表明，circPTK2（hsa_circ_0008305）通过控制NSCLC中的TIF1γ来抑制TGF-β诱导的EMT和转移，揭示了circRNA调节TGF-β诱导的EMT和肿瘤转移的新机制，并提示circPTK2过表达可为恶性NSCLC治疗提供线索。

图注：在TGF-β诱导的NSCLC细胞EMT过程中TIF1γ 和circPTK2表达下调。a：TGF-β1（5ng / ml）处理24小时后，A549细胞发生上皮-间质转化（EMT）。观察细胞形态并用相差显微镜（上图）拍照，比例尺，50μm。通过蛋白质印迹检查EMT相关蛋白的表达，包括E-钙粘蛋白E-cadherin，N-钙粘蛋白N-cadherin和波形蛋白Vimentin（左下）和TIF1γ蛋白（右下）。b：circRNA芯片检测TGF-β1处理0小时或24小时的两组A549细胞检测绘制circRNA表达层次聚类热图，circPTK2（hsa_circRNA_104703）的表达用箭头表示。cdef:RT-PCR，sanger测序，northblot和免疫荧光实验鉴定circPTK2（hsa_circRNA_104703）特异性存在，并主要分布在细胞质中。

3、CircRNA微阵列分析鉴定用于检测胃癌的新型循环生物标志物

论文题目：CircRNA microarray profiling identifies a novel circulating biomarker for detection of gastric cancer

杂志：Mol Cancer. 影响因子：7.776

通讯作者单位：南京医科大学南京第一医院

该研究前期通过circRNA高通量筛选胃癌患者血浆中circRNA差异分子，并鉴定到circ-KIAA124在胃癌中低表达，结合临床资料分析发现circ-KIAA1244与TNM分期、淋巴转移和患者总体存活时间长成负相关，同时在血浆外泌体中也检测到circ-KIAA1244，提示该分子可作为胃癌分子诊断的新型标志物。通过circBank数据库的进一步预测分析发现circ-KIAA1244互作的circRNA-miRNA-mRNA分子网络。为后续深入研究circ-KIAA1244分子机制研究提供了线索。该文献具体解读文章见历史文章：circBank助力胃癌研究发表于Molecular Cancer。

图注：circ-KIAA1244作为胃癌诊断标志物的理论模型示意图

文献列表：

来源：geneseed