无义介导的RNA降解（Nonsense-mediated decay, NMD）是真核生物一种重要的mRNA质量控制方式，细胞通过检验终止密码子与最后一个剪接接头的距离是否超过55nt来判断该终止密码子是否为提前终止密码子（Premature Termination Codon, PTC）从而决定是否降解该RNA。因此经典的NMD通路是一种RNA剪接依赖的机制。假基因是一种失去了蛋白编码能力或者表达能力的基因，通常由基因重复产生，基因组上的DNA重复可以形成非加工型假基因，而逆转录形成的基因重复会形成加工型假基因。假基因容易形成截短的蛋白产生细胞毒性，因此假基因的活性通常受到抑制。由于假基因通常含有PTC, 因此大量的非加工型假基因可以通过NMD的方式降解。然而，加工型假基因由于缺少内含子而不能通过NMD的机制降解，那么加工型的假基因是否进化出其他的方式来进行降解并不清楚。近日，中山大学王金凯教授课题组在Genome Biology杂志发表题为“Positive natural selection of N6-methyladenosine on the RNAs of processed pseudogenes”论文揭示加工型假基因在进化过程中在达尔文正向选择的驱动下快速积累产生m6A motif 的突变，从而造成加工型假基因的m6A水平显著高于同源的蛋白编码基因，进化出利用m6A降解加工型假基因的方式。这些进化出的m6A位点对于降解加工型假基因防止其通过ceRNA的机制干扰同源蛋白编码基因的表达调控网络发挥了重要作用。该论文的第一作者为王金凯教授课题组的两名博士研究生谭利强和程维晟同学。这项工作揭示了m6A RNA修饰的新的进化意义，即通过降解加工型假基因来缓解加工型假基因对同源蛋白编码基因表达调控网络的干扰，为进一步揭示假基因的m6A修饰在人类疾病中的作用和机理奠定了基础。该工作得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金和广州市科技计划的支持。 E N D 论文原文链接为：https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-021-02402-2来源：中山医学院
